脫硫廢水先經預處理系統(tǒng)進行絮凝、沉降及中和，減少廢水中的懸浮物，提高廢水pH值，為深度處理做準備。廢水進入脫硫廢水前池，通過輸送泵將脫硫廢水輸送至脫硫廢水預處理區(qū)域的脫硫廢水緩沖池。通過池內一級廢水輸送泵送至一級反應器。脫硫廢水緩沖池設曝氣攪拌裝置，防止懸浮物沉降。通過曝氣裝置還可以進一步降低廢水的COD。一級反應器分為中和箱和絮凝箱兩個部分。
在中和箱內，通過添加Ca(OH)2，將廢水pH調整到10～11進行攪拌反應生成CaCO3沉淀和Mg(OH)2沉淀，在后級澄清器中沉淀分離。同時，在此pH值下，多種重金屬離子均生成氫氧化物沉淀從廢水中分離。中和箱出水自流進入絮凝箱，絮凝箱投加凝聚劑FeCl3以及助凝劑PAM以使得絮凝物變得更大更容易沉淀，以便一步能在澄清器中分離出束。同時一級反應器也預留有機硫加藥界面。
廢水從一級反應器自流進入一級澄清器，廢水中的絮凝物通過重力作用沉積在澄清器底部，濃縮成泥渣，由刮泥裝置清除，并通過一級污泥輸送泵送至污泥緩沖罐。清水則上升至澄清器頂部通過環(huán)形三角溢流堰自流至中間水池貯存。二級反應器分為沉淀箱和絮凝箱兩個部分。在沉淀箱內投加Na2CO3，進行攪拌反應。在絮凝箱中投加有機硫進一步降低廢水中的重金屬離子濃度，使出水重金屬濃度完全滿足排放標準。同時投加凝聚劑FeCl3使生成較大礬花從廢水中除去。絮凝箱出水投加助凝劑PAM，使礬花進一步長大，以利于沉淀分離。級反應器出水自流進入二級澄清器。廢水中的絮凝物通過重力作用沉積在澄清器底部，濃縮成泥渣。濃縮污泥由刮泥裝置清除，并通過一級污泥輸送泵送至污泥緩沖罐準備壓濾。二級澄清器出水也可直接自流至清水箱。清水箱出水設有干灰加濕泵以及自用水泵。